Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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