Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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SEMA3BQ13214 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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SEMA3BQ13214 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SEMA3BQ13214 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SEMA3BQ13214 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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