Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms