Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP7AQ04656 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms