Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.7 ms