Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms