Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPCQ01831 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPCQ01831 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
XPCQ01831 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPCQ01831 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPCQ01831 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPCQ01831 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPCQ01831 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPCQ01831 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
XPCQ01831 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
XPCQ01831 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
XPCQ01831 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
XPCQ01831 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XPCQ01831 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XPCQ01831 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XPCQ01831 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
XPCQ01831 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XPCQ01831 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XPCQ01831 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPCQ01831 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPCQ01831 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPCQ01831 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
XPCQ01831 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPCQ01831 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPCQ01831 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPCQ01831 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPCQ01831 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPCQ01831 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPCQ01831 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms