Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms