Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL23P62829 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms