Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms