Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATP5EP56381 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms