Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKAA2P54646 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKAA2P54646 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKAA2P54646 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKAA2P54646 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKAA2P54646 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRKAA2P54646 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms