Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACLYP53396 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACLYP53396 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACLYP53396 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACLYP53396 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms