Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms