Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP4P49662 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP4P49662 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP4P49662 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP4P49662 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP4P49662 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms