Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM4P49221 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM4P49221 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM4P49221 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM4P49221 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM4P49221 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM4P49221 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM4P49221 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM4P49221 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM4P49221 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM4P49221 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM4P49221 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM4P49221 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM4P49221 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms