Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGIRP43119 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGIRP43119 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms