Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms