Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms