Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRMP28827 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
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