Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2P22307 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2P22307 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2P22307 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2P22307 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2P22307 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2P22307 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2P22307 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2P22307 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2P22307 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2P22307 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2P22307 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2P22307 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2P22307 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2P22307 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms