Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB1P20618 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms