Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD58P19256 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD58P19256 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD58P19256 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD58P19256 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD58P19256 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD58P19256 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD58P19256 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD58P19256 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD58P19256 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD58P19256 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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