Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIG1P18858 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIG1P18858 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIG1P18858 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIG1P18858 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIG1P18858 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIG1P18858 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIG1P18858 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIG1P18858 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIG1P18858 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LIG1P18858 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LIG1P18858 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LIG1P18858 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIG1P18858 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms