Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFAP13804 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFAP13804 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFAP13804 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETFAP13804 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ETFAP13804 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms