Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC5P13010 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms