Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGA3P0DJD8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms