Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIL1P09327 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIL1P09327 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VIL1P09327 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIL1P09327 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIL1P09327 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIL1P09327 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIL1P09327 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIL1P09327 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIL1P09327 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VIL1P09327 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VIL1P09327 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VIL1P09327 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIL1P09327 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIL1P09327 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VIL1P09327 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIL1P09327 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIL1P09327 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIL1P09327 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIL1P09327 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIL1P09327 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIL1P09327 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIL1P09327 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIL1P09327 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIL1P09327 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms