Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms