Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM2P07951 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM2P07951 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM2P07951 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPM2P07951 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPM2P07951 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms