Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms