Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD1O95696 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD1O95696 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD1O95696 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD1O95696 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD1O95696 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD1O95696 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD1O95696 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD1O95696 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD1O95696 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD1O95696 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD1O95696 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD1O95696 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD1O95696 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD1O95696 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD1O95696 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms