Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAPLNO95428 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPLNO95428 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms