Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB5O95377 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB5O95377 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB5O95377 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB5O95377 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB5O95377 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB5O95377 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB5O95377 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB5O95377 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB5O95377 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB5O95377 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB5O95377 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB5O95377 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB5O95377 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB5O95377 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB5O95377 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB5O95377 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms