Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms