Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM6AO15550 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM6AO15550 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms