Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBTB39O15060 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms