Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms