Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASKO14936 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASKO14936 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CASKO14936 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CASKO14936 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CASKO14936 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASKO14936 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms