Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRTO14522 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
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