Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DIRC3C9JPN6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms