Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms