Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms