Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms