Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L4A6NEF3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms