Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms