Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL125P-201ENST00000480790 294 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC099508.2-201ENST00000563098 510 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 C16orf97-204ENST00000566628 487 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC015574.1-201ENST00000615194 489 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC027250.1-201ENST00000621305 951 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC009122.1-201ENST00000640559 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CCDC174-201ENST00000303688 2714 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TTC39C-203ENST00000540918 4117 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CFB-271ENST00000425368 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 KLK10-203ENST00000391805 3006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SULF1-203ENST00000419716 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 OR4D2-201ENST00000545221 1551 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TP63-212ENST00000456148 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AP003784.1-201ENST00000622964 1749 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 KCNMA1-AS1-206ENST00000600782 1755 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ATP1A2-201ENST00000361216 5421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ATXN7L3-201ENST00000389384 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TMEM267-206ENST00000512085 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 PPP2R2B-208ENST00000504198 2011 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AP005230.1-205ENST00000639316 2015 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC091078.3-201ENST00000556708 2284 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 PCSK2-201ENST00000262545 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CARF-216ENST00000444724 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TTC31-201ENST00000233623 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 UBA7-201ENST00000333486 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL138889.1-202ENST00000451317 3630 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SAMD8-204ENST00000542569 6782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MDP1-201ENST00000288087 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TAS2R60-201ENST00000332690 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 LST1-203ENST00000339530 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ACTRT1-201ENST00000371124 1437 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 LCN1-202ENST00000371781 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CDK15-202ENST00000410091 1780 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC011747.2-201ENST00000418358 1036 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL591644.1-201ENST00000436102 764 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MIATNB-204ENST00000437071 1006 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL162584.1-201ENST00000437097 633 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MDC1-AS1-201ENST00000442150 738 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MSC-AS1-201ENST00000457356 4220 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ZBTB20-AS5-201ENST00000465249 622 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC004917.1-202ENST00000475791 760 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL627309.7-201ENST00000494149 755 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TRIM60-204ENST00000512596 1888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 IGKV1-35-201ENST00000517744 285 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC104117.2-201ENST00000523735 515 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RNF41-211ENST00000552656 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC064805.1-202ENST00000569279 3493 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC116348.3-201ENST00000569459 699 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL023803.1-201ENST00000570096 187 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 LINC02564-201ENST00000572573 920 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TTN-AS1-236ENST00000590040 855 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC018809.1-201ENST00000602411 553 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 PDE4DIP-247ENST00000618504 567 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 STK36-202ENST00000392105 4821 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 FLII-215ENST00000545457 3975 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ATG9A-202ENST00000396761 3799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ZNF750-201ENST00000269394 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 GOSR2-218ENST00000638634 3446 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms