Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AGXT2-206ENST00000618015 2181 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 GINS4-209ENST00000523277 3873 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 EFNA5-201ENST00000333274 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 IGSF1-206ENST00000370910 4406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 NUDCD2-201ENST00000302764 8005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms