Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms