Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms